温州市妇幼保健所创建于1956年，现址位于新城大道温州市公共卫生中心大楼，工作用房5500平方米。
温州市妇幼保健所以“保健为中心，以保障生殖健康为目的，实行保健和临床相结合，面向群体、面向基层和预防为主”的方针，围绕《中国儿童发展纲要》和《中国妇女发展纲要》目标，认真贯彻实施《中华人民共和国母婴保健法》及实施办法，开展了妇女五期保健、孕产妇系统管理、儿童系统管理、托幼机构卫生保健管理、妇女病防治、计划生育技术服务及婚前保健等一系列服务。全市的妇幼保健三级网络日趋完善，妇女儿童的健康状况明显改善，妇幼保健服务质量逐步提高。尤其是近年来，我所进一步提高服务质量，依法开展了新生儿疾病筛查、听力筛查、产前诊断等工作，努力提高出生人口素质、降低婴幼儿孕产妇死亡率。
温州市妇幼保健所承担着全市妇幼保健的技术指导、科研、教学、培训等工作，设有“温州市生殖健康服务中心”、“温州市新生儿疾病筛查中心”、“温州市涉外婚检定点单位”、“温州市儿童听力筛查管理中心”、“妇幼卫生信息管理中心”。
保健内容有：主要开展妇女各期常见病的防治、孕期保健咨询、婚前保健咨询、儿童常见病的防治、儿童健康体检、口腔保健、眼及听力保健、营养及心理咨询、集居儿童卫生保健管理等。
现温州市妇幼保健所与温州市第三人民医院合署成立温州市妇幼保健院，新的妇幼保健院将努力体现如下特色：
一、积极推行“人性化”服务。妇幼保健机构的服务对象主要是妇女儿童，又以孕产妇占很大一部分，故在服务设施、服务环境、服务流程上将充分体现“以人为本”的服务理念，推行“人性化”服务，让妇女儿童真正享受到温馨、便捷、优质的保健服务。
二、立足保健，开展系列服务。根据市场需求和“提高出生人口素质”的基本国策要求，继续开展优生优育系列保健服务，具体做法是：1、抓好婚前保健质量，把好优生优育第一关。2、加强围产保健，积极开展产前诊断、遗传咨询、新生儿疾病筛查、听力筛查等工作，减少先天、后天因素所致缺陷。3、做好儿童系统保健管理和托幼机构卫生指导，加大科学育儿的宣传力度。4、积极开展生殖保健服务。
三、充分体现保健与临床紧密结合的特色。我们将在原有基础上，不断完善保健的功能，同时开展临床医疗服务，以产科、康复病房为主，建立以妇产科、妇女保健、儿童保健为特色的温州市妇幼保健院，真正实现保健与临床的结合。